Dal 1999 al 2005 è stato Presidente della Commissione Europea. Nel 2006 Romano Prodi è stato eletto leader della coalizione di centro sinistra in Italia e dopo una vittoria alle elezioni del 2006 è diventato Presidente del Consiglio, fino all'8 maggio 2008. Da allora è Presidente della Foundation for Worldwide Cooperation e nel luglio 2008-2010 è stato nominato Presidente del Panel di alto livello per il mantenimento della pace in Africa delle Nazioni Unite e dell'Unione africana. Dal 2010 al novembre 2015 è stato Professore alla CEIBS (China Europe International Business School)di Shanghai e ora è Membro del Board della stessa Scuola.